Анализ группы «озорные белки» вконтакте

Трёхмерная структура белковых комплексов

Молекулярные структуры многих белковых комплексов были разрешены с помощью рентгеноструктурного анализа. Первой такой структурой был миоглобин кашалота. Позднее для определения трёхмерной структуры белковых комплексов также стали применять ЯМР. Так, например, одной из первых была получена структура кальмодулин-связанных доменов, взаимодействующих с кальмодулином. Этот метод хорошо подходит для определения слабых белок-белковых взаимодействий.

Домены

Благодаря развитию методов разрешения трёхмерной структуры белков удалось выделить структурные домены, которые участвуют в образовании ББВ. Такими, например, являются:

  • SH2-домен, связывающий фосфорилированные белки;
  • SH3-домен, специфичный к пролин-богатым последовательностям;
  • PTB-домен, взаимодействующий с последовательностями, содержащими фосфотирозиновую группу;
  • LIM-домен, содержащий цистеин-богатый мотив цинкового пальца и способный связываться с PDZ-доменом и себе подобными;
  • SAM-домен, связывающий белки, не содержащие данный домен;
  • PDZ-домен, узнающий мотив S/TXV на C-конце белка, а также LIM-домены или себе подобные;
  • FERM-домен, способный связывать PI(4,5)P2 (фосфоинозитол-4,5-бисфосфат).

Биологические эффекты белок-белковых взаимодействий

Белок-белковые взаимодействия играют важную роль во многих биологических процессах. Функция и активность белка в большинстве случаев изменяются при связывании с белками-партнёрами. Они могут оказывать значительное влияние на кинетические параметры фермента за счёт аллостерического эффекта, приводить к его инактивации (например, при связывании фермента с ингибитором) или к изменению специфичности фермента к своему субстрату.

Помимо этого, взаимодействие белков друг с другом может приводить к формированию нового центра связывания для субстрата на поверхности взаимодействия двух молекул. За счёт взаимодействия двух или более ферментов друг с другом становится возможным , что увеличивает эффективность ферментативных реакций за счёт стабилизации интермедиатов и повышения их локальной концентрации.

озорные белки .

Озорные Белки

Нажми для просмотра

Где с
пользой
провести
время всей
семьей? Кто
такие
альпаки?
Где живут
кролики?
Ответы на
эти
вопросы
можно…
 
 
 
Тэги:
 
Парк приключений «Озорные белки». Обзор.

Нажми для просмотра

«Озорные
белки» —
самый
безопасный
парк и не
имеет
аналогов в
России. Мы
создали
лучшее
место для
самых…
 
 
 
Тэги:
 
Парк Озорные Белки

Нажми для просмотра

Все серии
Озорной
семейки.
Белки и
Стрелки в
одном
сборнике:
Подарочек,
Душка Мопс,
А спорим?!,
Мечта…
 
 
 
Тэги:
 
Озорная семейка — Белка и Стрелка — Все серии подряд (сборник 11) Поучительный мультсериал для детей

Нажми для просмотра

Скорее
смотрим
сборник
ТОПовых
серий
Белки и
Стрелки!
Продолжени
е
знаменитой
истории о
«звездной»
 
 
 
Тэги:
 
Озорная семейка — Сборник ТОПовых серий | Поучительный мультсериал для детей

Нажми для просмотра

Все серии
Озорной
семейки.
Белки и
Стрелки в
одном
сборнике:
Сюрприз из
Америки,
Через
тюбики,
Артист…
 
 
 
Тэги:
 
Озорная семейка — Белка и Стрелка — Все серии подряд (сборник 5)

Нажми для просмотра

Скорее
смотрим
сборник
Самые
лучшие
серии
Белки и
Стрелки!
Продолжени
е
знаменитой
истории о
«звездной»
 
 
 
Тэги:
 
Озорная семейка — Самые лучшие серии (сборник) | Поучительный мультсериал для детей

Нажми для просмотра

Все серии
Озорной
семейки.
Белки и
Стрелки в
одном
сборнике:
Одни дома,
Попасть на
TV, Чувство
полета,…
 
 
 
Тэги:
 
Озорная семейка — Белка и Стрелка — Все серии подряд (сборник 3)

Нажми для просмотра

ВЛОГ
Детский
парк
развлечени
й
начинается
с того, что
мы
посетили
контактный
зоопарк и
покормили
животных….
 
 
 
Тэги:
 
VLOG ДЕТСКИЙ ПАРК развлечений Озорные белки

Нажми для просмотра

Все серии
Озорной
семейки.
Белки и
Стрелки в
одном
сборнике:
Рыбалка
для
Бублика,
Цирк — это
диагноз,…
 
 
 
Тэги:
 
Озорная семейка — Белка и Стрелка — Все серии подряд (сборник 6)

Нажми для просмотра

Мультики
#Белка и
#Стрелка —
Самые
классные
новогодние
мультики!Н
вогодние
мультфильм
ы от
Озорной
семейки:…
 
 
 
Тэги:
 
Белка и Стрелка Озорная семейка — новогодние серии — Мультики про новый год и зиму

Нажми для просмотра

Скорее
смотрим
сборник
всех серий
про
настоящую
дружбу!
Подпишись
на нас
прямо
сейчас и
всегда
будешь
полу…
 
 
 
Тэги:
 
Озорная семейка — Сборник всех серий про дружбу | Поучительный мультсериал для детей

Нажми для просмотра

Онлайн
игра с
Царевной ►

Кукла-игру
ка Царевна
► Посуда с

 
 
 
Тэги:
 
Жила была Царевна — новые серии — Мульти-пульти — мультики для девочек

Нажми для просмотра

Смотрите
новый Влог
ПАРК
АТТРАКЦИОН
ОВ в
Анталии
катаемся
на ВСЕХ
каруселях —
Ярослава в
Комнате
Страха!…
 
 
 
Тэги:
 
Влог ПАРК АТТРАКЦИОНОВ в Анталии катаемся на ВСЕХ каруселях — Ярослава в Комнате Страха!

Нажми для просмотра

Некоторые
белки в
городских
парках
настолько
смелые, что
буквально
выхватываю
т орешки из
рук и…
залеза…
 
 
 
Тэги:
 
до смешного наглая белка в парке

Нажми для просмотра

Сюжет про
парк
«Озорные
белки»
на
телеканале
Санкт-Пете
бург.
 
 
 
Тэги:
 
Парк Озорные Белки на ТВ!

Нажми для просмотра

«Озорны
белки» —
самый
безопасный
парк и не
имеет
аналогов в
России. Мы
создали
лучшее
место.
 
 
 
Тэги:
 
Аттракцион Танк в парке Озорные Белки

Нажми для просмотра

«Озорные
белки» —
самый
безопасный
парк и не
имеет
аналогов в
России. Мы
создали
лучшее
место для
самых…
 
 
 
Тэги:
 
Гости парка Озорные Белки

Нажми для просмотра

«Озорны
белки» —
самый
безопасный
парк и не
имеет
аналогов в
России. Мы
создали
лучшее
место.
 
 
 
Тэги:
 
Кормление альпака в парке Озорные Белки

Нажми для просмотра

Все серии
Озорной
семейки
про Новый
Год в одном
сборнике!
Подпишись
на нас
прямо
сейчас и
всегда
будешь…
 
 
 
Тэги:
 
Озорная семейка — Все серии про новый Год!

Нажми для просмотра

Как
отлично
провести
время с
детьми??
Покормить
альпака. .
 
 
 
Тэги:
 
АЛЬПАКИ Озорные белки, парк приключений для всей семьи. Зеленогорск. Симагино. Ленинградская область» rel=»spf-prefetch

Нажми для просмотра

Описание отсутсвует
 
 
 
Тэги:
 
Парк приключений «Озорные белки»» rel=»spf-prefetch

Сети белок-белковых взаимодействий

Основная статья: Интерактом

Визуализация интерактома человека, где точки обозначают белки, а соединяющие их синие линии — взаимодействия между белками

Информация, содержащаяся в базах ББВ, позволяет строить сети белковых взаимодействий. Сеть ББВ для одного конкретного белка вполне возможно описать, например, с помощью текста. Но задача создания диаграммы всевозможных внутриклеточных ББВ поистине сложна и трудноизобразима. Одним из примеров вручную созданной молекулярной карты взаимодействий является карта контроля клеточного цикла, созданная Куртом Коном (Kurt Kohn) в 1999 году. Базируясь на карте Кона, Швиковски (Schwikowski) и др. в 2000 году опубликовали карту ББВ в дрожжах, объединившую 1548 взаимодействующих протеина, информация о которых была получена методом двугибридного анализа. При визуализации для первоначального расположения вершин использовался метод послойного изображения графа, а затем полученное изображение было улучшено за счет применения силового (force based) алгоритма.

Чтобы упростить сложную задачу визуализации, были разработаны различные биоинформатические инструменты, которые также позволяют сочетать информацию о ББВ с другими типами данных. К примеру, широко используется пакет с открытым исходным кодом Cytoscape, к которому доступна масса плагинов. Для визуализации и анализа очень больших сетей подходит пакет Pajek.

Важная роль ББВ в физиологических и патологических процессах является хорошей мотивацией для расширения интерактома. В качестве примеров уже опубликованных интерактомов можно привести thyroid-специфичный интерактом DREAM и PP1α-интеракто в человеческом мозге.

Евгений Тутлаев

Очень нравится писать о путешествиях и туризме! Открыт и буду рад сотрудничеству с турфирмами, гидами, организаторами путешествий, авиаперевозчиками! Пишите!

Оцените автора